Winorośl rosła w Burgundii już w czasach rzymskich, co potwierdzają znaleziska archeologiczne. Prawdziwy rozkwit przyniosło średniowiecze, gdy winnice przejęły klasztory: benedyktyni z Cluny (założonego w 910 roku) i cystersi z opactwa Cîteaux (od 1098 roku).
Cystersi uważnie obserwowali, że sąsiednie działki dają co roku inne owoce. Oddzielali je i otaczali murami, tworząc tzw. clos (winnice zamknięte murem). Największym z nich jest Clos de Vougeot, ukończony i obmurowany do 1336 roku.
W XIV i XV wieku Burgundią rządzili książęta z dynastii Walezjuszy, a Dijon było stolicą ich państwa. W 1395 roku książę Filip Śmiały nakazał wykarczować szczep Gamay, a za właściwy dla regionu uznał Pinot Noir. Po rewolucji francuskiej kościelne winnice sprzedano, a podziały spadkowe rozdrobniły je na bardzo małe parcele.
W 1936 roku pojawiły się pierwsze burgundzkie apelacje (AOC, chronione nazwy pochodzenia), oparte na granicach dawnych działek. W 2015 roku 1247 climats, czyli nazwanych działek Côte de Nuits i Côte de Beaune, wraz z Beaune i historycznym centrum Dijon wpisano na listę światowego dziedzictwa UNESCO.